Когда устанавливать счётчик ?
Тогда и только тогда когда сайт ( или хотя-бы основная его часть ) будет готов. Если человек "кликнувший" по ссылке из рейтинга попадёт на страничку с единственной надписью "Пока тут пусто, но скоро я что-нибудь придумаю" то шансы, что он когда-нибудь к вам вернётся равны нулю (впрочем это относится к любой системе продвижения сайтов ). Возможное исключение: если на странице указана тема будущего сайта, дата открытия и установлена форма подписки на приглашение к открытию.

Какой счётчик устанавливать ?
Это зависит от того, что вы хотите получить. Если вам необходима информация для дальнейшего развития вашей странички, то лучшим вариантом будет счётчик системы статистики, или счётчик TopList. Если ваша страничка еще очень молода, и вы хотите чтобы о ней узнали, поставьте на неё тематический или региональный счётчик. Также помогает установка мало известного ( посещений этак 100 в день ) счётчика или рейтинга, который ведётся по опросам посетителей, поскольку в этих системах проще пробится на верхние места. На страницу Интрасети, главное для которой - скорость доступа лучше всего поставить скриптовый или региональный счётчик. И наконец если автор сайта хочет знать только сколько человек посетили его страничку лучше всего установить просто счётчик.

Сколько счётчиков устанавливать ?
Теоретически - сколько угодно. НО:

1. Если счётчики наверху страницы и их очень много посетитель может просто уйти не дожидаясь их загрузки.
2. Если на страничке есть только выбор русский/английский, а счётчиков больше трёх, ни один из счётчиков не сработает. Посетитель сразу "кликнет" на нужную стрелочку, не дожидаясь их загрузки.
3. Опять же, если счётчиков много может успеть сработать лишь часть из них, потом на всех будут разные цифры.
4. Устанавливать больше одного скриптового или просто счётчика бессмысленно.